MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5I

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010124	CTA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010124	CCA	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010124	GCAGC	2	10	107	116	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010124	C	6	6	116	121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_010124	G	6	6	127	132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010124	GTC	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010124	GAC	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010124	GTC	2	6	836	841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010124	CGT	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010124	GC	4	8	968	975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010124	GAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010124	GGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010124	GCC	2	6	1103	1108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010124	CCT	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010124	GTG	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010124	A	6	6	2081	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010124	CGCC	2	8	2088	2095	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_010124	TTCG	2	8	2119	2126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010124	GCCC	2	8	2223	2230	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_010124	CCA	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010124	A	7	7	3565	3571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010124	CCA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010124	AAG	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010124	AGG	2	6	3936	3941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010124	GAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010124	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010124	TAC	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010124	GCG	2	6	3989	3994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010124	GCC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010124	AGG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010124	CA	3	6	4147	4152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010124	TCT	2	6	4210	4215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010124	TTC	2	6	4951	4956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010124	CAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010124	TCA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010124	TGA	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010124	CCAG	2	8	6839	6846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010124	T	6	6	6949	6954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010124	GAA	2	6	8488	8493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010124	GAA	2	6	8497	8502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010124	AAG	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010124	GCC	2	6	9395	9400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010124	GGC	2	6	9407	9412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010124	C	7	7	9702	9708	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_010124	GAT	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010124	TGG	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010124	GCGG	2	8	9943	9950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010124	TGC	2	6	10005	10010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010124	CGGCG	2	10	10024	10033	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010124	CGC	2	6	10048	10053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010124	GA	3	6	10067	10072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010124	AAG	2	6	19445	19450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010124	AGA	2	6	19483	19488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010124	ATG	2	6	19490	19495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010124	A	8	8	19530	19537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010124	C	6	6	19561	19566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_010124	CCG	2	6	20132	20137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010124	AG	3	6	22073	22078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010124	GCG	2	6	22088	22093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010124	GA	3	6	22102	22107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010124	GAA	2	6	22471	22476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010124	GC	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010124	AG	3	6	22593	22598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010124	GTG	2	6	22635	22640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010124	TC	3	6	22658	22663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010124	TCTG	2	8	23777	23784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010124	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010124	GCG	2	6	23874	23879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010124	GGT	2	6	23919	23924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010124	GGC	2	6	23983	23988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010124	TGG	2	6	24964	24969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010124	TCA	2	6	25012	25017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010124	T	6	6	25116	25121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010124	GAA	2	6	26741	26746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010124	AG	3	6	26751	26756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010124	GAA	2	6	26757	26762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010124	AAG	2	6	26766	26771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010124	T	8	8	26797	26804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010124	GGTT	2	8	26840	26847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010124	GCT	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010124	GAA	2	6	27099	27104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010124	AAG	2	6	27108	27113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010124	AGA	2	6	27125	27130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010124	AAG	2	6	28261	28266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010124	T	6	6	28267	28272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010124	AAG	2	6	28295	28300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010124	GAA	2	6	28310	28315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010124	GAAA	2	8	28317	28324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010124	GA	3	6	28565	28570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010124	GGC	2	6	28604	28609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010124	CAGGG	2	10	28675	28684	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010124	TCC	2	6	28703	28708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010124	TGAT	2	8	29706	29713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010124	GAC	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010124	TGCT	2	8	31411	31418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010124	GCGA	2	8	31450	31457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010124	A	7	7	31958	31964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010124	TGATG	2	10	31972	31981	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010124	T	6	6	31993	31998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010124	ATA	3	9	32014	32022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010124	GAT	2	6	32045	32050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010124	CCTAG	2	10	32061	32070	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_010124	T	6	6	33033	33038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010124	GC	3	6	33046	33051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010124	T	6	6	33070	33075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010124	CG	3	6	34584	34589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010124	TCT	2	6	34938	34943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010124	TGG	2	6	35486	35491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010124	A	6	6	35514	35519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010124	AAT	2	6	35975	35980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010124	TGA	2	6	36027	36032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010124	CG	4	8	36067	36074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010124	CAGG	2	8	36095	36102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010124	CCA	2	6	36134	36139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010124	AGC	2	6	36207	36212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010124	AGCA	2	8	36236	36243	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010124	CCT	2	6	36887	36892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010124	GTG	2	6	36918	36923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010124	A	6	6	36972	36977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010124	CCT	2	6	37836	37841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010124	AGTG	2	8	37851	37858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010124	GGCC	2	8	38465	38472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010124	ATCGG	2	10	38513	38522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010124	CGG	2	6	38532	38537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010124	CTG	2	6	38555	38560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010124	CAAGGC	2	12	38587	38598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010124	TTCG	2	8	38620	38627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010124	CAA	2	6	38653	38658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010124	CGA	2	6	38671	38676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010124	GC	3	6	38680	38685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010124	AGC	2	6	38696	38701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010124	CTGC	2	8	38707	38714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010124	CGC	2	6	38752	38757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010124	ACC	2	6	38781	38786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010124	GAT	2	6	38797	38802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010124	CCG	2	6	38804	38809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.